Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC39A9Q9NUM3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms