Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC56

PCDH9, Protocadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH9Q9HC56 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH9Q9HC56 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH9Q9HC56 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH9Q9HC56 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms