Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED28Q9H204 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MED28Q9H204 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms