Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KATNB1Q9BVA0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KATNB1Q9BVA0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms