Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf50Q9BV19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf50Q9BV19 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms