Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A3Q9BRY0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A3Q9BRY0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC39A3Q9BRY0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms