Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PANX1Q96RD7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX1Q96RD7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms