Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW9

TAMM41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAMM41Q96BW9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAMM41Q96BW9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAMM41Q96BW9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAMM41Q96BW9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms