Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCE1Q969G3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCE1Q969G3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCE1Q969G3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms