Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HAVCR2Q8TDQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms