Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6Q795 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6Q795 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6Q795 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6Q795 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6Q795 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6Q795 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6Q795 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6Q795 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6Q795 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6Q795 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6Q795 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6Q795 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6Q795 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6Q795 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6Q795 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6Q795 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6Q795 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6Q795 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6Q795 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6Q795 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6Q795 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6Q795 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6Q795 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6Q795 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6Q795 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6Q795 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6Q795 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6Q795 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6Q795 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6Q795 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6Q795 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6Q795 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6Q795 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6Q795 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6Q795 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6Q795 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6Q795 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6Q795 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6Q795 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6Q795 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6Q795 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6Q795 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6Q795 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6Q795 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6Q795 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6Q795 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6Q795 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6Q795 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6Q795 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6Q795 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6Q795 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6Q795 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6Q795 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6Q795 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6Q795 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6Q795 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6Q795 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6Q795 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6Q795 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6Q795 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6Q795 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6Q795 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6Q795 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6Q795 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6Q795 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6Q795 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6Q795 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms