Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf116Q5BN46 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf116Q5BN46 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms