Protein–RNA interactions for Protein: Q3E827

LSO1, Protein LSO1, yeastyeast

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSO1Q3E827 UBC5YDR059C 447 nt7.34□□□□□ -1.23
LSO1Q3E827 BUD26YDR241W 288 nt7.34□□□□□ -1.23
LSO1Q3E827 YJL171CYJL171C 1191 nt7.34□□□□□ -1.23
LSO1Q3E827 THI80YOR143C 960 nt7.34□□□□□ -1.23
LSO1Q3E827 RFS1YBR052C 633 nt7.34□□□□□ -1.23
LSO1Q3E827 MET13YGL125W 1803 nt7.34□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YGL218WYGL218W 651 nt7.33□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YSC83YHR017W 1158 nt7.33□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 PRE3YJL001W 648 nt7.33□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 TDA4YJR116W 840 nt7.33□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 RPC19YNL113W 429 nt7.33□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 AAH1YNL141W 1044 nt7.33□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 MRL1YPR079W 1146 nt7.33□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 JIP4YDR475C 2631 nt7.33□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YMR027WYMR027W 1413 nt7.33□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 KAR5YMR065W 1515 nt7.32□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 IGD1YFR017C 588 nt7.32□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 QCR6YFR033C 444 nt7.32□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YGR273CYGR273C 525 nt7.32□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YLR030WYLR030W 792 nt7.32□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.32□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YPR084WYPR084W 1371 nt7.32□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 DXO1YDR370C 1329 nt7.31□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 UPS3YDR185C 540 nt7.31□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 GLY1YEL046C 1164 nt7.31□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 CHS7YHR142W 951 nt7.31□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 IMP3YHR148W 552 nt7.31□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 ELF1YKL160W 438 nt7.31□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 CDD1YLR245C 429 nt7.31□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 OLA1YBR025C 1185 nt7.31□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 TED1YIL039W 1422 nt7.3□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YGR137WYGR137W 375 nt7.3□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 PHB2YGR231C 933 nt7.3□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YAL064WYAL064W 285 nt7.3□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 ATG29YPL166W 642 nt7.3□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 TIF5YPR041W 1218 nt7.3□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 MET16YPR167C 786 nt7.3□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 PEX32YBR168W 1242 nt7.3□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 COR1YBL045C 1374 nt7.3□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 MEP1YGR121C 1479 nt7.3□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 RSC2YLR357W 2670 nt7.29□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 COG7YGL005C 840 nt7.29□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 MOB1YIL106W 945 nt7.29□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt7.29□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YML094C-AYML094C-A 402 nt7.29□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 ADH3YMR083W 1128 nt7.29□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 OSW5YMR148W 447 nt7.29□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 IFA38YBR159W 1044 nt7.29□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 TOD6YBL054W 1578 nt7.29□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 RRI1YDL216C 1323 nt7.28□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 SEC24YIL109C 2781 nt7.28□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 INO1YJL153C 1602 nt7.28□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YCR025CYCR025C 411 nt7.28□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 ADH7YCR105W 1086 nt7.28□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 PAU5YFL020C 369 nt7.28□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 IRC6YFR043C 714 nt7.28□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 CLC1YGR167W 702 nt7.28□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YJR096WYJR096W 849 nt7.28□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 YBR292CYBR292C 372 nt7.28□□□□□ -1.24
LSO1Q3E827 RSP5YER125W 2430 nt7.27□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 SPO74YGL170C 1242 nt7.27□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 CYC3YAL039C 810 nt7.27□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 SRY1YKL218C 981 nt7.27□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 YOR062CYOR062C 807 nt7.27□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 GET4YOR164C 939 nt7.27□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 CLN1YMR199W 1641 nt7.27□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 ECM7YLR443W 1347 nt7.27□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 WSC3YOL105C 1671 nt7.26□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 RRG1YDR065W 1098 nt7.26□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 SKI6YGR195W 741 nt7.26□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt7.26□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 ARG3YJL088W 1017 nt7.26□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 TPK1YJL164C 1194 nt7.26□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 HMS2YJR147W 1077 nt7.26□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 LAC1YKL008C 1257 nt7.26□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 SRP102YKL154W 735 nt7.26□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 YLR225CYLR225C 1224 nt7.26□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 RCF1YML030W 480 nt7.26□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 RQC1YDR333C 2172 nt7.26□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 HXT7YDR342C 1713 nt7.25□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 HXT6YDR343C 1713 nt7.25□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 FRE5YOR384W 2085 nt7.25□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 PAN5YHR063C 1140 nt7.25□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 TFA2YKR062W 987 nt7.25□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 YAP7YOL028C 738 nt7.25□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 EHT1YBR177C 1356 nt7.24□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 LAP2YNL045W 2016 nt7.24□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 KRE28YDR532C 1158 nt7.24□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 MOB2YFL034C-B 864 nt7.24□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 NCS6YGL211W 1080 nt7.24□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 POP6YGR030C 477 nt7.24□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 FLX1YIL134W 936 nt7.24□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 YLR365WYLR365W 333 nt7.24□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 URA4YLR420W 1095 nt7.24□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 YNL174WYNL174W 573 nt7.24□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 NOP13YNL175C 1212 nt7.24□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 YOR169CYOR169C 465 nt7.24□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.23□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 PAU15YIR041W 375 nt7.23□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 MTR2YKL186C 555 nt7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.8 ms