Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LONRF1Q17RB8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LONRF1Q17RB8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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