Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NPTX1Q15818 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms