Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23BQ15437 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23BQ15437 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23BQ15437 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23BQ15437 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC23BQ15437 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC23BQ15437 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC23BQ15437 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC23BQ15437 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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