Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARB2Q14108 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARB2Q14108 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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