Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOFQ13790 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOFQ13790 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOFQ13790 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOFQ13790 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOFQ13790 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOFQ13790 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOFQ13790 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOFQ13790 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOFQ13790 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOFQ13790 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOFQ13790 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOFQ13790 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOFQ13790 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOFQ13790 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOFQ13790 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOFQ13790 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOFQ13790 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOFQ13790 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOFQ13790 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
APOFQ13790 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
APOFQ13790 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOFQ13790 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOFQ13790 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOFQ13790 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOFQ13790 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOFQ13790 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOFQ13790 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOFQ13790 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOFQ13790 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOFQ13790 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOFQ13790 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOFQ13790 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOFQ13790 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOFQ13790 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOFQ13790 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOFQ13790 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOFQ13790 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOFQ13790 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOFQ13790 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOFQ13790 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOFQ13790 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOFQ13790 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOFQ13790 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOFQ13790 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOFQ13790 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOFQ13790 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOFQ13790 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOFQ13790 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOFQ13790 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOFQ13790 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOFQ13790 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOFQ13790 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOFQ13790 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOFQ13790 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOFQ13790 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOFQ13790 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOFQ13790 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOFQ13790 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOFQ13790 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOFQ13790 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOFQ13790 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOFQ13790 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOFQ13790 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOFQ13790 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOFQ13790 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOFQ13790 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOFQ13790 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOFQ13790 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOFQ13790 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOFQ13790 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOFQ13790 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOFQ13790 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOFQ13790 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOFQ13790 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOFQ13790 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOFQ13790 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOFQ13790 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOFQ13790 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOFQ13790 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOFQ13790 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOFQ13790 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOFQ13790 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOFQ13790 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOFQ13790 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOFQ13790 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOFQ13790 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOFQ13790 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOFQ13790 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOFQ13790 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOFQ13790 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOFQ13790 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOFQ13790 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOFQ13790 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOFQ13790 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOFQ13790 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOFQ13790 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOFQ13790 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOFQ13790 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOFQ13790 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms