Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1H3Q13133 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1H3Q13133 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
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