Protein–RNA interactions for Protein: Q12016

VPS68, Vacuolar protein sorting-associated protein 68, yeastyeast

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS68Q12016 TMT1YER175C 900 nt5.9□□□□□ -1.46
VPS68Q12016 SUR7YML052W 909 nt5.9□□□□□ -1.46
VPS68Q12016 SHP1YBL058W 1272 nt5.9□□□□□ -1.46
VPS68Q12016 ATO2YNR002C 849 nt5.9□□□□□ -1.46
VPS68Q12016 MNS1YJR131W 1650 nt5.9□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 ADE12YNL220W 1302 nt5.9□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 MCM5YLR274W 2328 nt5.9□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 CDC34YDR054C 888 nt5.89□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 CIN4YMR138W 576 nt5.89□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 MDM31YHR194W 1740 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 TRR1YDR353W 960 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 PRS2YER099C 957 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 TSA1YML028W 591 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 RQC1YDR333C 2172 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 YCK1YHR135C 1617 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 RTG2YGL252C 1767 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 YJL045WYJL045W 1905 nt5.87□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 HDA1YNL021W 2121 nt5.87□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 DFM1YDR411C 1026 nt5.87□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 YEL068CYEL068C 333 nt5.87□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 HSP12YFL014W 330 nt5.87□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.87□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 RPL21AYBR191W 483 nt5.87□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 RSC4YKR008W 1878 nt5.87□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 PPS1YBR276C 2424 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 FRT1YOR324C 1809 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 WHI2YOR043W 1461 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 UGX2YDL169C 672 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 YDL172CYDL172C 480 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 SYF2YGR129W 648 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 ERP5YHR110W 639 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 ASK1YKL052C 879 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 MAS1YLR163C 1389 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 DMA1YHR115C 1251 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 HAP3YBL021C 435 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 PGM1YKL127W 1713 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 PRI2YKL045W 1587 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 YTP1YNL237W 1380 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 YGL235WYGL235W 537 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 LEU5YHR002W 1074 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 BCY1YIL033C 1251 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 BSC4YNL269W 396 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 YPR204WYPR204W 3099 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS68Q12016 PYK2YOR347C 1521 nt5.84□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 ARP3YJR065C 1350 nt5.83□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 PXL1YKR090W 2121 nt5.83□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 GTT3YEL017W 1014 nt5.83□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 SPO7YAL009W 780 nt5.83□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.83□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 YPR114WYPR114W 948 nt5.83□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 MRPS5YBR251W 924 nt5.83□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 GPB2YAL056W 2643 nt5.83□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 TPO3YPR156C 1869 nt5.83□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 ISN1YOR155C 1353 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 MTF2YDL044C 1323 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 HST3YOR025W 1344 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 COX20YDR231C 618 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 YIR042CYIR042C 711 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 CSL4YNL232W 879 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 CRP1YHR146W 1398 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 CIR2YOR356W 1896 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 YNL200CYNL200C 741 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 SMK1YPR054W 1167 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 PYC2YBR218C 3543 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 COR1YBL045C 1374 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 RAD24YER173W 1980 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 BDF2YDL070W 1917 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 VPS61YDR136C 573 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 RRN10YBL025W 438 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 YHM2YMR241W 945 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 ECM38YLR299W 1983 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 ECM10YEL030W 1935 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 COA1YIL157C 594 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 GCD11YER025W 1584 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 GUD1YDL238C 1470 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 AIM33YML087C 939 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 NDE1YMR145C 1683 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 AFG1YEL052W 1530 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 CTF3YLR381W 2202 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS68Q12016 AAD15YOL165C 432 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 ATG12YBR217W 561 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 MRK1YDL079C 1506 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 RPN11YFR004W 921 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 CTF8YHR191C 402 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 MTC2YKL098W 1074 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 ATG4YNL223W 1485 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 RGT2YDL138W 2292 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 snR82snR82 268 nt5.75□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 DON1YDR273W 1098 nt5.75□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 RPT3YDR394W 1287 nt5.75□□□□□ -1.49
VPS68Q12016 PHB1YGR132C 864 nt5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 147.9 ms