Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EGR3Q06889 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EGR3Q06889 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EGR3Q06889 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EGR3Q06889 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EGR3Q06889 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EGR3Q06889 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EGR3Q06889 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EGR3Q06889 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EGR3Q06889 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EGR3Q06889 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EGR3Q06889 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EGR3Q06889 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EGR3Q06889 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EGR3Q06889 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EGR3Q06889 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EGR3Q06889 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EGR3Q06889 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EGR3Q06889 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EGR3Q06889 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EGR3Q06889 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EGR3Q06889 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms