Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 VMA3YEL027W 483 nt5.81□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.81□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 PET112YBL080C 1626 nt5.81□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 CNE1YAL058W 1509 nt5.8□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 HXT17YNR072W 1695 nt5.8□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 YKL102CYKL102C 306 nt5.8□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 SML1YML058W 315 nt5.8□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 YOL046CYOL046C 675 nt5.8□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 CTF19YPL018W 1110 nt5.8□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 LAT1YNL071W 1449 nt5.8□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 TMT1YER175C 900 nt5.79□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 RPL7AYGL076C 735 nt5.79□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 RPL7BYPL198W 735 nt5.79□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 YMC1YPR058W 924 nt5.79□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 IFA38YBR159W 1044 nt5.79□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 YFL042CYFL042C 2025 nt5.79□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 EXG1YLR300W 1347 nt5.78□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 VHT1YGR065C 1782 nt5.78□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 MRPS12YNR036C 462 nt5.78□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 TEP1YNL128W 1305 nt5.77□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 PAT1YCR077C 2391 nt5.77□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 YOX1YML027W 1158 nt5.77□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 PPT1YGR123C 1542 nt5.77□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 COX15YER141W 1461 nt5.77□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 AIM46YHR199C 933 nt5.76□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 RPR1RPR1 369 nt5.76□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 DAP1YPL170W 459 nt5.76□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 GLN1YPR035W 1113 nt5.76□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 FMP40YPL222W 2067 nt5.75□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 YEL020CYEL020C 1683 nt5.75□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 RIX7YLL034C 2514 nt5.75□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 PTK2YJR059W 2457 nt5.74□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 CCT8YJL008C 1707 nt5.74□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 HDA1YNL021W 2121 nt5.74□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 RPT3YDR394W 1287 nt5.74□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 VMA4YOR332W 702 nt5.74□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.74□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 AMA1YGR225W 1782 nt5.74□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 KEX2YNL238W 2445 nt5.73□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 RPE1YJL121C 717 nt5.73□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 SRL2YLR082C 1179 nt5.73□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 MSO1YNR049C 633 nt5.73□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 YFR006WYFR006W 1608 nt5.73□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 PYC2YBR218C 3543 nt5.72□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 YTP1YNL237W 1380 nt5.72□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 YIL077CYIL077C 963 nt5.72□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 GTO3YMR251W 1101 nt5.72□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 ALD6YPL061W 1503 nt5.72□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 AMD2YDR242W 1650 nt5.72□□□□□ -1.49
NEJ1Q06148 PTC4YBR125C 1182 nt5.71□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 BZZ1YHR114W 1902 nt5.7□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 FZF1YGL254W 900 nt5.7□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 ASF1YJL115W 840 nt5.7□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.69□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 YCK1YHR135C 1617 nt5.69□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 GUD1YDL238C 1470 nt5.69□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 CRH1YGR189C 1524 nt5.69□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 CLB1YGR108W 1416 nt5.68□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 FMO1YHR176W 1299 nt5.68□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 RPL10YLR075W 666 nt5.68□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 Q0010Q0010 387 nt5.68□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 ILV1YER086W 1731 nt5.68□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 PCS60YBR222C 1632 nt5.67□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 BCY1YIL033C 1251 nt5.67□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.67□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.67□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.67□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.67□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.67□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.67□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.67□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.67□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 ATF1YOR377W 1578 nt5.67□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 TRP5YGL026C 2124 nt5.66□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 GAT1YFL021W 1533 nt5.66□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 BUG1YDL099W 1026 nt5.66□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 YHC3YJL059W 1227 nt5.66□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 RPS3YNL178W 723 nt5.66□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 LSC1YOR142W 990 nt5.66□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 YOR300WYOR300W 309 nt5.66□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 SKN1YGR143W 2316 nt5.66□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 MCH1YDL054C 1461 nt5.65□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 RPN11YFR004W 921 nt5.65□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 ZIM17YNL310C 525 nt5.65□□□□□ -1.5
NEJ1Q06148 SGV1YPR161C 1974 nt5.65□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 YLL067CYLL067C 3618 nt5.65□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 SUB2YDL084W 1341 nt5.65□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 PTC3YBL056W 1407 nt5.65□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 KKQ8YKL168C 2175 nt5.65□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 EMW1YNL313C 2715 nt5.64□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 LIA1YJR070C 978 nt5.64□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 HOC1YJR075W 1191 nt5.64□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 YKL153WYKL153W 510 nt5.64□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 FPR3YML074C 1236 nt5.64□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 AAD14YNL331C 1131 nt5.64□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 YNR040WYNR040W 771 nt5.64□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 YOL131WYOL131W 327 nt5.64□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 LGE1YPL055C 999 nt5.64□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 RPN7YPR108W 1290 nt5.64□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 GFA1YKL104C 2154 nt5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.7 ms