Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 PPT1YGR123C 1542 nt7.93□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 SLA2YNL243W 2907 nt7.92□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 CYB2YML054C 1776 nt7.92□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 TIM22YDL217C 624 nt7.92□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 YNL120CYNL120C 486 nt7.92□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 COA2YPL189C-A 207 nt7.92□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 YPR150WYPR150W 522 nt7.92□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 ECM31YBR176W 939 nt7.92□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 ZRT2YLR130C 1269 nt7.91□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 HEM1YDR232W 1647 nt7.91□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 AQR1YNL065W 1761 nt7.9□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 CMK2YOL016C 1344 nt7.9□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 RAD59YDL059C 717 nt7.9□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.9□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 YDR415CYDR415C 1125 nt7.9□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 YPT1YFL038C 621 nt7.9□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 MOG1YJR074W 657 nt7.9□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 YNR014WYNR014W 639 nt7.9□□□□□ -1.14
NSE3Q05541 HHY1YEL059W 309 nt7.89□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 TOS6YNL300W 309 nt7.89□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 PAP1YKR002W 1707 nt7.89□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 MIP1YOR330C 3765 nt7.88□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 PEX31YGR004W 1389 nt7.88□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 RRP1YDR087C 837 nt7.88□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 HEL1YKR017C 1656 nt7.88□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 RGT2YDL138W 2292 nt7.87□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 CRF1YDR223W 1404 nt7.87□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 IES1YFL013C 2079 nt7.87□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt7.87□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 MEH1YKR007W 555 nt7.87□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 ASN2YGR124W 1719 nt7.86□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 IVY1YDR229W 1362 nt7.86□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 NTG1YAL015C 1200 nt7.86□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 GPA1YHR005C 1419 nt7.86□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 CMR1YDL156W 1569 nt7.85□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 CCR4YAL021C 2514 nt7.85□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 BUR6YER159C 429 nt7.85□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 HGH1YGR187C 1185 nt7.85□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 YNR048WYNR048W 1182 nt7.85□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 YOS9YDR057W 1629 nt7.85□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 LYS21YDL131W 1323 nt7.84□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 PEX3YDR329C 1326 nt7.84□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 MSY1YPL097W 1479 nt7.84□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 HEM2YGL040C 1029 nt7.84□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 YJR107WYJR107W 987 nt7.84□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 YKR032WYKR032W 315 nt7.84□□□□□ -1.15
NSE3Q05541 GSH1YJL101C 2037 nt7.83□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 EAF5YEL018W 840 nt7.83□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 FBA1YKL060C 1080 nt7.83□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 YLL066CYLL066C 3618 nt7.83□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 YLL067CYLL067C 3618 nt7.83□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 MSS116YDR194C 1995 nt7.82□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 YIL092WYIL092W 1902 nt7.82□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 LAS17YOR181W 1902 nt7.82□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 YDL218WYDL218W 954 nt7.82□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 YOR200WYOR200W 399 nt7.82□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 UIP4YPL186C 915 nt7.82□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 LAG2YOL025W 1983 nt7.82□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 YFL052WYFL052W 1398 nt7.82□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 DYS1YHR068W 1164 nt7.81□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 SQT1YIR012W 1296 nt7.81□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 RPS3YNL178W 723 nt7.81□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 RPL5YPL131W 894 nt7.81□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 EMP65YER140W 1671 nt7.81□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 THI2YBR240C 1353 nt7.81□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 RIX7YLL034C 2514 nt7.81□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 ICE2YIL090W 1476 nt7.81□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 GPH1YPR160W 2709 nt7.8□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 YDR015CYDR015C 240 nt7.8□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 DOT5YIL010W 648 nt7.8□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 CNM67YNL225C 1746 nt7.8□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 PRP40YKL012W 1752 nt7.79□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 CCC2YDR270W 3015 nt7.79□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 BUG1YDL099W 1026 nt7.79□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 AGP2YBR132C 1791 nt7.79□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 NTE1YML059C 5040 nt7.78□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 MAK31YCR020C-A 267 nt7.78□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 MMS21YEL019C 804 nt7.78□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 AIM24YJR080C 1185 nt7.78□□□□□ -1.16
NSE3Q05541 NSE5YML023C 1671 nt7.77□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 YNL194CYNL194C 906 nt7.77□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 YNL285WYNL285W 372 nt7.77□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 NHA1YLR138W 2958 nt7.77□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 AMD2YDR242W 1650 nt7.76□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 SIT4YDL047W 936 nt7.76□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 BUD32YGR262C 786 nt7.76□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 RPP1YHR062C 882 nt7.76□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 ECM14YHR132C 1293 nt7.76□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 CBT1YKL208W 816 nt7.76□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 MRPL24YMR193W 777 nt7.76□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 UTP6YDR449C 1323 nt7.76□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 NMD5YJR132W 3147 nt7.75□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 PET112YBL080C 1626 nt7.75□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt7.75□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 YJL107CYJL107C 1164 nt7.75□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 NAT5YOR253W 531 nt7.75□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 ENV7YPL236C 1095 nt7.75□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 GAA1YLR088W 1845 nt7.75□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 RSM23YGL129C 1353 nt7.74□□□□□ -1.17
NSE3Q05541 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.9 ms