Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YPT1YFL038C 621 nt7.41□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 COG1YGL223C 1254 nt7.4□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 GCN3YKR026C 918 nt7.4□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 RPL10YLR075W 666 nt7.4□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 TOS6YNL300W 309 nt7.4□□□□□ -1.22
SYF1Q04048 ILV1YER086W 1731 nt7.4□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 ADE12YNL220W 1302 nt7.39□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 YDR415CYDR415C 1125 nt7.39□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 YCR061WYCR061W 1896 nt7.38□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 ICL2YPR006C 1728 nt7.38□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 EDC3YEL015W 1656 nt7.38□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 MSY1YPL097W 1479 nt7.38□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 PPS1YBR276C 2424 nt7.38□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 ACO1YLR304C 2337 nt7.38□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 HST3YOR025W 1344 nt7.38□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 MIP1YOR330C 3765 nt7.38□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 FRE5YOR384W 2085 nt7.37□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 ISN1YOR155C 1353 nt7.37□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 YER137CYER137C 447 nt7.37□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 SLA2YNL243W 2907 nt7.36□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 BNA3YJL060W 1335 nt7.36□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 RFS1YBR052C 633 nt7.36□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 LDS1YAL018C 978 nt7.35□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 FBA1YKL060C 1080 nt7.35□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 PEX13YLR191W 1161 nt7.35□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 CDC19YAL038W 1503 nt7.35□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 CIT3YPR001W 1461 nt7.35□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 CCC2YDR270W 3015 nt7.35□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 PEX31YGR004W 1389 nt7.34□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 CCT3YJL014W 1605 nt7.34□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 RMA1YKL132C 1293 nt7.34□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 CIN4YMR138W 576 nt7.34□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 MCH1YDL054C 1461 nt7.34□□□□□ -1.23
SYF1Q04048 THI2YBR240C 1353 nt7.33□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 YOR389WYOR389W 1875 nt7.33□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 YDL129WYDL129W 876 nt7.33□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 SQT1YIR012W 1296 nt7.33□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 TAH11YJR046W 1815 nt7.33□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 GEF1YJR040W 2340 nt7.32□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 RPR2YIR015W 435 nt7.32□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 RRS1YOR294W 612 nt7.32□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 MAK32YCR019W 1092 nt7.31□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 COX16YJL003W 357 nt7.31□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 GON7YJL184W 372 nt7.31□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 AIM24YJR080C 1185 nt7.31□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 YJR107WYJR107W 987 nt7.31□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 YNR014WYNR014W 639 nt7.31□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 PXL1YKR090W 2121 nt7.31□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 HEL1YKR017C 1656 nt7.31□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 EHD3YDR036C 1503 nt7.31□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 CMK2YOL016C 1344 nt7.3□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 RHB1YCR027C 630 nt7.3□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 SSP120YLR250W 705 nt7.3□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt7.3□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 COR1YBL045C 1374 nt7.3□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 YPL277CYPL277C 1464 nt7.3□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 KDX1YKL161C 1302 nt7.29□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 GFA1YKL104C 2154 nt7.29□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 YDL119CYDL119C 924 nt7.29□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 RPE1YJL121C 717 nt7.29□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 CIR2YOR356W 1896 nt7.29□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 SMC5YOL034W 3282 nt7.28□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 YEN1YER041W 2280 nt7.28□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 TRR1YDR353W 960 nt7.28□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 SHO1YER118C 1104 nt7.28□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 YKR032WYKR032W 315 nt7.28□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 YBR226CYBR226C 411 nt7.28□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 TPO3YPR156C 1869 nt7.28□□□□□ -1.24
SYF1Q04048 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt7.27□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt7.27□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 PAC10YGR078C 600 nt7.27□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 DYS1YHR068W 1164 nt7.27□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 LCB3YJL134W 1230 nt7.27□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 MRPS16YPL013C 366 nt7.27□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 MRPS5YBR251W 924 nt7.27□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 CYB2YML054C 1776 nt7.27□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 ADE17YMR120C 1779 nt7.27□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 EXG1YLR300W 1347 nt7.27□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 COX20YDR231C 618 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 POP5YAL033W 522 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 YML012C-AYML012C-A 378 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 SNO4YMR322C 714 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 HSP33YOR391C 714 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 HSP32YPL280W 714 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 YMC1YPR058W 924 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 ATG12YBR217W 561 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 MDM31YHR194W 1740 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 TOS2YGR221C 1869 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 PRI2YKL045W 1587 nt7.25□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 VTS1YOR359W 1572 nt7.25□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 CDC34YDR054C 888 nt7.25□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 RPL5YPL131W 894 nt7.25□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 SNU71YGR013W 1863 nt7.25□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 AGP2YBR132C 1791 nt7.25□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 MRK1YDL079C 1506 nt7.24□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 PYK2YOR347C 1521 nt7.24□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 KTR1YOR099W 1182 nt7.24□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 HRQ1YDR291W 3234 nt7.24□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.23□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 BRL1YHR036W 1416 nt7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.4 ms