Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK6Q00534 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK6Q00534 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms