Protein–RNA interactions for Protein: P62837

UBE2D2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D2P62837 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2D2P62837 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D2P62837 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms