Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME3P61289 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME3P61289 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME3P61289 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME3P61289 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME3P61289 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSME3P61289 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME3P61289 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME3P61289 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME3P61289 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME3P61289 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME3P61289 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSME3P61289 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PSME3P61289 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME3P61289 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME3P61289 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSME3P61289 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME3P61289 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME3P61289 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME3P61289 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME3P61289 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME3P61289 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME3P61289 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSME3P61289 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSME3P61289 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSME3P61289 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME3P61289 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME3P61289 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME3P61289 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME3P61289 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME3P61289 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME3P61289 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME3P61289 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSME3P61289 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME3P61289 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME3P61289 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME3P61289 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME3P61289 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME3P61289 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSME3P61289 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME3P61289 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME3P61289 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME3P61289 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME3P61289 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME3P61289 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME3P61289 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME3P61289 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME3P61289 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME3P61289 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME3P61289 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME3P61289 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME3P61289 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME3P61289 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME3P61289 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME3P61289 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME3P61289 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME3P61289 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME3P61289 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME3P61289 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME3P61289 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME3P61289 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME3P61289 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME3P61289 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME3P61289 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME3P61289 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME3P61289 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME3P61289 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME3P61289 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME3P61289 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME3P61289 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME3P61289 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSME3P61289 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSME3P61289 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSME3P61289 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSME3P61289 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSME3P61289 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSME3P61289 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSME3P61289 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSME3P61289 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSME3P61289 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSME3P61289 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSME3P61289 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSME3P61289 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSME3P61289 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSME3P61289 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSME3P61289 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSME3P61289 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSME3P61289 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSME3P61289 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSME3P61289 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSME3P61289 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSME3P61289 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSME3P61289 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSME3P61289 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSME3P61289 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSME3P61289 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSME3P61289 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSME3P61289 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME3P61289 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME3P61289 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 411.3 ms