Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3BP55884 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3BP55884 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3BP55884 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms