Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2KP53803 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2KP53803 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms