Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IDH3AP50213 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms