Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA3P32297 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms