Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA2P29317 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EPHA2P29317 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms