Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTX3P26022 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTX3P26022 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTX3P26022 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTX3P26022 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTX3P26022 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTX3P26022 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTX3P26022 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTX3P26022 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTX3P26022 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTX3P26022 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTX3P26022 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTX3P26022 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTX3P26022 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTX3P26022 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTX3P26022 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTX3P26022 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTX3P26022 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTX3P26022 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTX3P26022 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTX3P26022 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTX3P26022 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTX3P26022 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTX3P26022 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTX3P26022 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTX3P26022 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTX3P26022 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTX3P26022 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTX3P26022 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTX3P26022 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTX3P26022 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTX3P26022 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTX3P26022 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTX3P26022 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTX3P26022 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTX3P26022 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTX3P26022 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTX3P26022 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTX3P26022 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTX3P26022 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTX3P26022 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTX3P26022 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTX3P26022 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTX3P26022 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTX3P26022 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTX3P26022 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTX3P26022 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTX3P26022 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTX3P26022 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTX3P26022 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTX3P26022 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTX3P26022 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTX3P26022 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTX3P26022 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTX3P26022 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTX3P26022 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTX3P26022 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTX3P26022 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTX3P26022 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTX3P26022 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTX3P26022 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTX3P26022 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTX3P26022 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTX3P26022 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTX3P26022 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTX3P26022 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTX3P26022 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTX3P26022 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTX3P26022 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTX3P26022 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTX3P26022 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTX3P26022 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTX3P26022 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTX3P26022 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTX3P26022 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTX3P26022 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTX3P26022 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTX3P26022 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTX3P26022 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTX3P26022 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTX3P26022 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTX3P26022 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTX3P26022 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTX3P26022 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTX3P26022 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTX3P26022 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTX3P26022 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTX3P26022 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTX3P26022 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTX3P26022 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTX3P26022 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTX3P26022 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTX3P26022 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTX3P26022 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTX3P26022 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTX3P26022 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTX3P26022 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTX3P26022 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTX3P26022 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTX3P26022 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms