Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP5F1P24539 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP5F1P24539 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms