Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME2P23368 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME2P23368 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME2P23368 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME2P23368 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME2P23368 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME2P23368 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME2P23368 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME2P23368 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME2P23368 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME2P23368 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME2P23368 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME2P23368 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME2P23368 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME2P23368 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME2P23368 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME2P23368 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME2P23368 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME2P23368 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME2P23368 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME2P23368 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME2P23368 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ME2P23368 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ME2P23368 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ME2P23368 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ME2P23368 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME2P23368 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME2P23368 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME2P23368 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME2P23368 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME2P23368 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME2P23368 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME2P23368 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME2P23368 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME2P23368 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME2P23368 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME2P23368 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME2P23368 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME2P23368 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME2P23368 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME2P23368 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME2P23368 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME2P23368 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME2P23368 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME2P23368 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME2P23368 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME2P23368 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME2P23368 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME2P23368 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME2P23368 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME2P23368 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME2P23368 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME2P23368 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME2P23368 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME2P23368 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME2P23368 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME2P23368 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME2P23368 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ME2P23368 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ME2P23368 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME2P23368 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME2P23368 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ME2P23368 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ME2P23368 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ME2P23368 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME2P23368 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME2P23368 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME2P23368 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME2P23368 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ME2P23368 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME2P23368 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME2P23368 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME2P23368 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms