Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT15P19012 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT15P19012 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT15P19012 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT15P19012 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT15P19012 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT15P19012 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT15P19012 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT15P19012 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT15P19012 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT15P19012 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT15P19012 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT15P19012 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT15P19012 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT15P19012 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT15P19012 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT15P19012 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT15P19012 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT15P19012 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT15P19012 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT15P19012 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT15P19012 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT15P19012 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT15P19012 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT15P19012 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT15P19012 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT15P19012 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT15P19012 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT15P19012 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT15P19012 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT15P19012 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT15P19012 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT15P19012 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT15P19012 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT15P19012 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT15P19012 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT15P19012 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT15P19012 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT15P19012 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT15P19012 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT15P19012 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT15P19012 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT15P19012 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT15P19012 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT15P19012 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT15P19012 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT15P19012 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT15P19012 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT15P19012 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT15P19012 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT15P19012 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT15P19012 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT15P19012 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT15P19012 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT15P19012 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT15P19012 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT15P19012 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT15P19012 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT15P19012 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT15P19012 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT15P19012 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT15P19012 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT15P19012 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT15P19012 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT15P19012 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT15P19012 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT15P19012 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT15P19012 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT15P19012 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT15P19012 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT15P19012 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT15P19012 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT15P19012 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT15P19012 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT15P19012 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT15P19012 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT15P19012 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT15P19012 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT15P19012 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT15P19012 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT15P19012 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT15P19012 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT15P19012 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT15P19012 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT15P19012 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT15P19012 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT15P19012 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT15P19012 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT15P19012 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT15P19012 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT15P19012 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT15P19012 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT15P19012 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT15P19012 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT15P19012 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT15P19012 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT15P19012 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT15P19012 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT15P19012 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT15P19012 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms