Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGF3P11487 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGF3P11487 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGF3P11487 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGF3P11487 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGF3P11487 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGF3P11487 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGF3P11487 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGF3P11487 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGF3P11487 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGF3P11487 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGF3P11487 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGF3P11487 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FGF3P11487 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGF3P11487 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGF3P11487 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGF3P11487 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGF3P11487 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGF3P11487 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGF3P11487 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGF3P11487 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGF3P11487 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGF3P11487 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGF3P11487 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGF3P11487 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGF3P11487 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGF3P11487 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGF3P11487 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGF3P11487 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGF3P11487 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGF3P11487 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGF3P11487 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGF3P11487 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGF3P11487 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGF3P11487 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGF3P11487 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGF3P11487 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FGF3P11487 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FGF3P11487 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGF3P11487 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGF3P11487 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGF3P11487 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGF3P11487 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGF3P11487 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGF3P11487 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGF3P11487 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGF3P11487 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGF3P11487 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGF3P11487 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGF3P11487 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGF3P11487 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGF3P11487 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGF3P11487 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGF3P11487 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGF3P11487 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGF3P11487 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGF3P11487 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGF3P11487 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGF3P11487 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGF3P11487 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGF3P11487 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGF3P11487 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGF3P11487 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGF3P11487 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGF3P11487 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGF3P11487 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGF3P11487 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
FGF3P11487 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGF3P11487 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGF3P11487 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGF3P11487 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGF3P11487 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGF3P11487 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGF3P11487 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGF3P11487 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGF3P11487 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGF3P11487 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGF3P11487 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGF3P11487 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGF3P11487 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGF3P11487 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGF3P11487 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGF3P11487 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGF3P11487 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FGF3P11487 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FGF3P11487 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGF3P11487 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGF3P11487 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGF3P11487 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGF3P11487 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FGF3P11487 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FGF3P11487 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGF3P11487 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGF3P11487 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGF3P11487 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGF3P11487 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGF3P11487 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGF3P11487 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGF3P11487 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGF3P11487 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms