Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHV3-30-5P0DP03 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHV3-30-5P0DP03 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-30-5P0DP03 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IGHV3-30-5P0DP03 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms