Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OPN1SWP03999 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OPN1SWP03999 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN1SWP03999 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN1SWP03999 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN1SWP03999 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1SWP03999 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1SWP03999 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1SWP03999 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1SWP03999 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1SWP03999 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1SWP03999 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1SWP03999 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1SWP03999 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1SWP03999 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms