Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHEK2O96017 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHEK2O96017 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms