Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMUO75648 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMUO75648 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMUO75648 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMUO75648 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMUO75648 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMUO75648 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMUO75648 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMUO75648 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMUO75648 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMUO75648 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMUO75648 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMUO75648 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMUO75648 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMUO75648 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMUO75648 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMUO75648 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMUO75648 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMUO75648 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMUO75648 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMUO75648 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMUO75648 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMUO75648 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMUO75648 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMUO75648 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMUO75648 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMUO75648 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMUO75648 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMUO75648 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMUO75648 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMUO75648 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMUO75648 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMUO75648 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMUO75648 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMUO75648 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMUO75648 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMUO75648 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMUO75648 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMUO75648 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMUO75648 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMUO75648 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMUO75648 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMUO75648 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMUO75648 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMUO75648 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMUO75648 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMUO75648 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMUO75648 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMUO75648 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMUO75648 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMUO75648 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMUO75648 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMUO75648 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMUO75648 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMUO75648 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMUO75648 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMUO75648 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMUO75648 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMUO75648 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMUO75648 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMUO75648 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMUO75648 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMUO75648 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMUO75648 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMUO75648 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMUO75648 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMUO75648 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMUO75648 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMUO75648 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMUO75648 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMUO75648 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMUO75648 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMUO75648 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMUO75648 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMUO75648 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMUO75648 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMUO75648 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMUO75648 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMUO75648 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMUO75648 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMUO75648 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMUO75648 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMUO75648 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMUO75648 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMUO75648 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMUO75648 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMUO75648 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMUO75648 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMUO75648 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMUO75648 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMUO75648 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMUO75648 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMUO75648 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMUO75648 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMUO75648 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMUO75648 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMUO75648 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMUO75648 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMUO75648 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMUO75648 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms