Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXTL3O43909 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXTL3O43909 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms