Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIF1CO43896 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF1CO43896 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF1CO43896 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms