Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD28O15084 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD28O15084 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms