Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP73A6NFT4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP73A6NFT4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms