Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLEC4AQ9UMR7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms