Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms