Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms