Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms