Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFDP1Q9UEE9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms